2021年4月26日，国家科技部通报了国家国际科技合作基地（简称国合基地）2020年度评估结果，以新疆地方与民族高发并教育部重点实验室为基础条件依托的国家国际科技合作基地—新疆地方性高发病国际科技合作基地的评估结果为合格，顺利通过2020年度国家国合基地的评估工作。

本次评估是国家科技部国际合作司对2006年以来已认定且持续开展国际科技合作的719家国合基地开展的系统性、全覆盖的综合绩效评估，包括形式审查、专家网络函评、会议评估等环节。经过专家组的综合评定，有104家评估等级为“优秀”， 180家为“良好”，306家为“合格”，129家为“待复评后确定等次”。

新疆地方性高发病国合基地以新疆地方与民族高发病教育部实验室的基础条件平台作为支撑条件，2014年5月，正式被认定为国家国际科技合作基地（示范型），本基地结合国家关于西部大开发的政策和“一带一路”的发展战略、机遇，紧密围绕新疆特有的民族和区域特点及当地卫生服务的迫切需求，近年来，承担了11项省部级的国际科技合作任务，开展了一系列高水平的科学研究和国际合作，取得了一定的具有本基地鲜明特色和优势的科研成果，充分发挥了基地的科技示范引领能力。